Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX3

Tfr2, Transferrin receptor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfr2Q9JKX3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tfr2Q9JKX3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tfr2Q9JKX3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tfr2Q9JKX3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tfr2Q9JKX3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tfr2Q9JKX3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tfr2Q9JKX3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tfr2Q9JKX3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tfr2Q9JKX3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tfr2Q9JKX3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tfr2Q9JKX3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfr2Q9JKX3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfr2Q9JKX3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfr2Q9JKX3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfr2Q9JKX3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfr2Q9JKX3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfr2Q9JKX3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfr2Q9JKX3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfr2Q9JKX3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfr2Q9JKX3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfr2Q9JKX3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfr2Q9JKX3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfr2Q9JKX3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfr2Q9JKX3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tfr2Q9JKX3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tfr2Q9JKX3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tfr2Q9JKX3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tfr2Q9JKX3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tfr2Q9JKX3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tfr2Q9JKX3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tfr2Q9JKX3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tfr2Q9JKX3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tfr2Q9JKX3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tfr2Q9JKX3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tfr2Q9JKX3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tfr2Q9JKX3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tfr2Q9JKX3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tfr2Q9JKX3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tfr2Q9JKX3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tfr2Q9JKX3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tfr2Q9JKX3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tfr2Q9JKX3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tfr2Q9JKX3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tfr2Q9JKX3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tfr2Q9JKX3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tfr2Q9JKX3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tfr2Q9JKX3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tfr2Q9JKX3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tfr2Q9JKX3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 399.4 ms