Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Nova1Q9JKN6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nova1Q9JKN6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nova1Q9JKN6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nova1Q9JKN6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nova1Q9JKN6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nova1Q9JKN6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nova1Q9JKN6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nova1Q9JKN6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nova1Q9JKN6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Nova1Q9JKN6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nova1Q9JKN6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nova1Q9JKN6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nova1Q9JKN6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nova1Q9JKN6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nova1Q9JKN6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nova1Q9JKN6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nova1Q9JKN6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nova1Q9JKN6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nova1Q9JKN6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms