Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AtrQ9JKK8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms