Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trem1Q9JKE2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms