Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms