Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC7

Ap4m1, AP-4 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4m1Q9JKC7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ap4m1Q9JKC7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms