Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pard6bQ9JK83 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pard6bQ9JK83 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms