Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ9

Cngb3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb3Q9JJZ9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cngb3Q9JJZ9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cngb3Q9JJZ9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cngb3Q9JJZ9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cngb3Q9JJZ9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cngb3Q9JJZ9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cngb3Q9JJZ9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cngb3Q9JJZ9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cngb3Q9JJZ9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cngb3Q9JJZ9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cngb3Q9JJZ9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cngb3Q9JJZ9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cngb3Q9JJZ9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cngb3Q9JJZ9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cngb3Q9JJZ9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cngb3Q9JJZ9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cngb3Q9JJZ9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cngb3Q9JJZ9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cngb3Q9JJZ9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cngb3Q9JJZ9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cngb3Q9JJZ9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cngb3Q9JJZ9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cngb3Q9JJZ9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cngb3Q9JJZ9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cngb3Q9JJZ9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cngb3Q9JJZ9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cngb3Q9JJZ9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cngb3Q9JJZ9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cngb3Q9JJZ9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cngb3Q9JJZ9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cngb3Q9JJZ9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cngb3Q9JJZ9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cngb3Q9JJZ9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cngb3Q9JJZ9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cngb3Q9JJZ9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cngb3Q9JJZ9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cngb3Q9JJZ9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cngb3Q9JJZ9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cngb3Q9JJZ9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cngb3Q9JJZ9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cngb3Q9JJZ9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cngb3Q9JJZ9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cngb3Q9JJZ9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cngb3Q9JJZ9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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