Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnga3Q9JJZ8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnga3Q9JJZ8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnga3Q9JJZ8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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