Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gfra4Q9JJT2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gfra4Q9JJT2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gfra4Q9JJT2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gfra4Q9JJT2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gfra4Q9JJT2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gfra4Q9JJT2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gfra4Q9JJT2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gfra4Q9JJT2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gfra4Q9JJT2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gfra4Q9JJT2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gfra4Q9JJT2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gfra4Q9JJT2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gfra4Q9JJT2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gfra4Q9JJT2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gfra4Q9JJT2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gfra4Q9JJT2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gfra4Q9JJT2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gfra4Q9JJT2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gfra4Q9JJT2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gfra4Q9JJT2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gfra4Q9JJT2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gfra4Q9JJT2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gfra4Q9JJT2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gfra4Q9JJT2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gfra4Q9JJT2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gfra4Q9JJT2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gfra4Q9JJT2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gfra4Q9JJT2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gfra4Q9JJT2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gfra4Q9JJT2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gfra4Q9JJT2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gfra4Q9JJT2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gfra4Q9JJT2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gfra4Q9JJT2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gfra4Q9JJT2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gfra4Q9JJT2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gfra4Q9JJT2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gfra4Q9JJT2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gfra4Q9JJT2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gfra4Q9JJT2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gfra4Q9JJT2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gfra4Q9JJT2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gfra4Q9JJT2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gfra4Q9JJT2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gfra4Q9JJT2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gfra4Q9JJT2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gfra4Q9JJT2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gfra4Q9JJT2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gfra4Q9JJT2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gfra4Q9JJT2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gfra4Q9JJT2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gfra4Q9JJT2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gfra4Q9JJT2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gfra4Q9JJT2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gfra4Q9JJT2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gfra4Q9JJT2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gfra4Q9JJT2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gfra4Q9JJT2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gfra4Q9JJT2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gfra4Q9JJT2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gfra4Q9JJT2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gfra4Q9JJT2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gfra4Q9JJT2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gfra4Q9JJT2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gfra4Q9JJT2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gfra4Q9JJT2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gfra4Q9JJT2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gfra4Q9JJT2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gfra4Q9JJT2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gfra4Q9JJT2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gfra4Q9JJT2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gfra4Q9JJT2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gfra4Q9JJT2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gfra4Q9JJT2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gfra4Q9JJT2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gfra4Q9JJT2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gfra4Q9JJT2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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