Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ72

Rprm, Protein reprimo, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RprmQ9JJ72 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RprmQ9JJ72 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RprmQ9JJ72 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RprmQ9JJ72 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RprmQ9JJ72 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RprmQ9JJ72 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RprmQ9JJ72 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RprmQ9JJ72 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RprmQ9JJ72 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RprmQ9JJ72 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RprmQ9JJ72 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RprmQ9JJ72 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RprmQ9JJ72 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RprmQ9JJ72 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RprmQ9JJ72 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RprmQ9JJ72 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RprmQ9JJ72 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RprmQ9JJ72 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RprmQ9JJ72 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RprmQ9JJ72 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RprmQ9JJ72 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RprmQ9JJ72 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RprmQ9JJ72 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RprmQ9JJ72 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RprmQ9JJ72 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RprmQ9JJ72 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RprmQ9JJ72 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RprmQ9JJ72 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RprmQ9JJ72 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms