Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS5

Sv2a, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2aQ9JIS5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms