Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ercc6l2Q9JIM3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ercc6l2Q9JIM3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ercc6l2Q9JIM3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ercc6l2Q9JIM3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ercc6l2Q9JIM3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ercc6l2Q9JIM3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ercc6l2Q9JIM3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ercc6l2Q9JIM3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ercc6l2Q9JIM3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Ercc6l2Q9JIM3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ercc6l2Q9JIM3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ercc6l2Q9JIM3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ercc6l2Q9JIM3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ercc6l2Q9JIM3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ercc6l2Q9JIM3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ercc6l2Q9JIM3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ercc6l2Q9JIM3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ercc6l2Q9JIM3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ercc6l2Q9JIM3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ercc6l2Q9JIM3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ercc6l2Q9JIM3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ercc6l2Q9JIM3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ercc6l2Q9JIM3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ercc6l2Q9JIM3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ercc6l2Q9JIM3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ercc6l2Q9JIM3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ercc6l2Q9JIM3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ercc6l2Q9JIM3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ercc6l2Q9JIM3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ercc6l2Q9JIM3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ercc6l2Q9JIM3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ercc6l2Q9JIM3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ercc6l2Q9JIM3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ercc6l2Q9JIM3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ercc6l2Q9JIM3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ercc6l2Q9JIM3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ercc6l2Q9JIM3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Ercc6l2Q9JIM3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ercc6l2Q9JIM3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Ercc6l2Q9JIM3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ercc6l2Q9JIM3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ercc6l2Q9JIM3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ercc6l2Q9JIM3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ercc6l2Q9JIM3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ercc6l2Q9JIM3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Ercc6l2Q9JIM3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Ercc6l2Q9JIM3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ercc6l2Q9JIM3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ercc6l2Q9JIM3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ercc6l2Q9JIM3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ercc6l2Q9JIM3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ercc6l2Q9JIM3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ercc6l2Q9JIM3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Ercc6l2Q9JIM3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ercc6l2Q9JIM3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ercc6l2Q9JIM3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ercc6l2Q9JIM3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ercc6l2Q9JIM3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ercc6l2Q9JIM3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ercc6l2Q9JIM3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ercc6l2Q9JIM3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ercc6l2Q9JIM3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ercc6l2Q9JIM3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Ercc6l2Q9JIM3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ercc6l2Q9JIM3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ercc6l2Q9JIM3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ercc6l2Q9JIM3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Ercc6l2Q9JIM3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Ercc6l2Q9JIM3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ercc6l2Q9JIM3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ercc6l2Q9JIM3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ercc6l2Q9JIM3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ercc6l2Q9JIM3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ercc6l2Q9JIM3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Ercc6l2Q9JIM3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ercc6l2Q9JIM3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ercc6l2Q9JIM3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Ercc6l2Q9JIM3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ercc6l2Q9JIM3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ercc6l2Q9JIM3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ercc6l2Q9JIM3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ercc6l2Q9JIM3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ercc6l2Q9JIM3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ercc6l2Q9JIM3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ercc6l2Q9JIM3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ercc6l2Q9JIM3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ercc6l2Q9JIM3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ercc6l2Q9JIM3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ercc6l2Q9JIM3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ercc6l2Q9JIM3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ercc6l2Q9JIM3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ercc6l2Q9JIM3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ercc6l2Q9JIM3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ercc6l2Q9JIM3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms