Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Copb1Q9JIF7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Copb1Q9JIF7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Copb1Q9JIF7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Copb1Q9JIF7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Copb1Q9JIF7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Copb1Q9JIF7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Copb1Q9JIF7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Copb1Q9JIF7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Copb1Q9JIF7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Copb1Q9JIF7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Copb1Q9JIF7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Copb1Q9JIF7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Copb1Q9JIF7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Copb1Q9JIF7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Copb1Q9JIF7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Copb1Q9JIF7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Copb1Q9JIF7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Copb1Q9JIF7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Copb1Q9JIF7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Copb1Q9JIF7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Copb1Q9JIF7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Copb1Q9JIF7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Copb1Q9JIF7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Copb1Q9JIF7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Copb1Q9JIF7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Copb1Q9JIF7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Copb1Q9JIF7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Copb1Q9JIF7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Copb1Q9JIF7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Copb1Q9JIF7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Copb1Q9JIF7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Copb1Q9JIF7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Copb1Q9JIF7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Copb1Q9JIF7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Copb1Q9JIF7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Copb1Q9JIF7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Copb1Q9JIF7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Copb1Q9JIF7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Copb1Q9JIF7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Copb1Q9JIF7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Copb1Q9JIF7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Copb1Q9JIF7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms