Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI74

Klhl1, Kelch-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl1Q9JI74 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klhl1Q9JI74 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klhl1Q9JI74 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klhl1Q9JI74 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klhl1Q9JI74 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klhl1Q9JI74 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klhl1Q9JI74 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klhl1Q9JI74 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klhl1Q9JI74 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klhl1Q9JI74 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klhl1Q9JI74 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klhl1Q9JI74 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klhl1Q9JI74 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klhl1Q9JI74 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl1Q9JI74 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl1Q9JI74 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl1Q9JI74 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl1Q9JI74 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl1Q9JI74 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl1Q9JI74 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl1Q9JI74 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl1Q9JI74 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl1Q9JI74 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl1Q9JI74 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl1Q9JI74 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl1Q9JI74 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl1Q9JI74 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl1Q9JI74 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl1Q9JI74 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl1Q9JI74 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl1Q9JI74 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl1Q9JI74 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl1Q9JI74 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl1Q9JI74 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl1Q9JI74 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl1Q9JI74 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl1Q9JI74 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl1Q9JI74 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl1Q9JI74 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl1Q9JI74 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl1Q9JI74 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl1Q9JI74 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl1Q9JI74 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl1Q9JI74 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl1Q9JI74 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl1Q9JI74 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl1Q9JI74 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klhl1Q9JI74 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klhl1Q9JI74 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klhl1Q9JI74 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klhl1Q9JI74 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms