Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pus3Q9JI38 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pus3Q9JI38 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pus3Q9JI38 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pus3Q9JI38 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pus3Q9JI38 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pus3Q9JI38 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pus3Q9JI38 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pus3Q9JI38 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Pus3Q9JI38 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Pus3Q9JI38 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pus3Q9JI38 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pus3Q9JI38 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pus3Q9JI38 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pus3Q9JI38 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pus3Q9JI38 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pus3Q9JI38 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pus3Q9JI38 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pus3Q9JI38 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pus3Q9JI38 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pus3Q9JI38 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pus3Q9JI38 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pus3Q9JI38 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pus3Q9JI38 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pus3Q9JI38 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pus3Q9JI38 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pus3Q9JI38 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pus3Q9JI38 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pus3Q9JI38 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Pus3Q9JI38 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pus3Q9JI38 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pus3Q9JI38 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pus3Q9JI38 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pus3Q9JI38 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pus3Q9JI38 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pus3Q9JI38 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pus3Q9JI38 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pus3Q9JI38 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pus3Q9JI38 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pus3Q9JI38 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pus3Q9JI38 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pus3Q9JI38 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Pus3Q9JI38 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pus3Q9JI38 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pus3Q9JI38 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pus3Q9JI38 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pus3Q9JI38 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pus3Q9JI38 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pus3Q9JI38 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pus3Q9JI38 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pus3Q9JI38 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pus3Q9JI38 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pus3Q9JI38 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pus3Q9JI38 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pus3Q9JI38 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pus3Q9JI38 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pus3Q9JI38 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pus3Q9JI38 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pus3Q9JI38 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pus3Q9JI38 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Pus3Q9JI38 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pus3Q9JI38 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pus3Q9JI38 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pus3Q9JI38 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pus3Q9JI38 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pus3Q9JI38 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pus3Q9JI38 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pus3Q9JI38 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pus3Q9JI38 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pus3Q9JI38 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pus3Q9JI38 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pus3Q9JI38 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pus3Q9JI38 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pus3Q9JI38 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pus3Q9JI38 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pus3Q9JI38 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pus3Q9JI38 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pus3Q9JI38 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pus3Q9JI38 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pus3Q9JI38 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pus3Q9JI38 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Pus3Q9JI38 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Pus3Q9JI38 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pus3Q9JI38 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pus3Q9JI38 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pus3Q9JI38 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pus3Q9JI38 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms