Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH9

Copz2, Coatomer subunit zeta-2, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz2Q9JHH9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copz2Q9JHH9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copz2Q9JHH9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copz2Q9JHH9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Copz2Q9JHH9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copz2Q9JHH9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copz2Q9JHH9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copz2Q9JHH9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copz2Q9JHH9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copz2Q9JHH9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copz2Q9JHH9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copz2Q9JHH9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copz2Q9JHH9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copz2Q9JHH9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copz2Q9JHH9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copz2Q9JHH9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copz2Q9JHH9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copz2Q9JHH9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copz2Q9JHH9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copz2Q9JHH9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copz2Q9JHH9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copz2Q9JHH9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copz2Q9JHH9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copz2Q9JHH9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copz2Q9JHH9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copz2Q9JHH9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copz2Q9JHH9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copz2Q9JHH9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copz2Q9JHH9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copz2Q9JHH9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copz2Q9JHH9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copz2Q9JHH9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copz2Q9JHH9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copz2Q9JHH9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copz2Q9JHH9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copz2Q9JHH9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copz2Q9JHH9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copz2Q9JHH9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copz2Q9JHH9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copz2Q9JHH9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copz2Q9JHH9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copz2Q9JHH9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copz2Q9JHH9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copz2Q9JHH9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copz2Q9JHH9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms