Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH5

Cxcl11, C-X-C motif chemokine 11, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl11Q9JHH5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cxcl11Q9JHH5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cxcl11Q9JHH5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cxcl11Q9JHH5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cxcl11Q9JHH5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cxcl11Q9JHH5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cxcl11Q9JHH5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cxcl11Q9JHH5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cxcl11Q9JHH5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cxcl11Q9JHH5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cxcl11Q9JHH5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cxcl11Q9JHH5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cxcl11Q9JHH5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cxcl11Q9JHH5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cxcl11Q9JHH5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cxcl11Q9JHH5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cxcl11Q9JHH5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cxcl11Q9JHH5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cxcl11Q9JHH5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cxcl11Q9JHH5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cxcl11Q9JHH5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cxcl11Q9JHH5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cxcl11Q9JHH5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cxcl11Q9JHH5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cxcl11Q9JHH5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cxcl11Q9JHH5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cxcl11Q9JHH5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cxcl11Q9JHH5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cxcl11Q9JHH5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cxcl11Q9JHH5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cxcl11Q9JHH5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cxcl11Q9JHH5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cxcl11Q9JHH5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cxcl11Q9JHH5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cxcl11Q9JHH5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cxcl11Q9JHH5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cxcl11Q9JHH5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cxcl11Q9JHH5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cxcl11Q9JHH5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms