Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldn12Q9ET43 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms