Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG4

Tmem27, Collectrin, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem27Q9ESG4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem27Q9ESG4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem27Q9ESG4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem27Q9ESG4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem27Q9ESG4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem27Q9ESG4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem27Q9ESG4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem27Q9ESG4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem27Q9ESG4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem27Q9ESG4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem27Q9ESG4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem27Q9ESG4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem27Q9ESG4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem27Q9ESG4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem27Q9ESG4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem27Q9ESG4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem27Q9ESG4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem27Q9ESG4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem27Q9ESG4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem27Q9ESG4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem27Q9ESG4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem27Q9ESG4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem27Q9ESG4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem27Q9ESG4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem27Q9ESG4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem27Q9ESG4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem27Q9ESG4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem27Q9ESG4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem27Q9ESG4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms