Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD6

Cmtm7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm7Q9ESD6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cmtm7Q9ESD6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cmtm7Q9ESD6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cmtm7Q9ESD6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cmtm7Q9ESD6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cmtm7Q9ESD6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cmtm7Q9ESD6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cmtm7Q9ESD6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cmtm7Q9ESD6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cmtm7Q9ESD6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cmtm7Q9ESD6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cmtm7Q9ESD6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cmtm7Q9ESD6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cmtm7Q9ESD6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cmtm7Q9ESD6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cmtm7Q9ESD6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cmtm7Q9ESD6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cmtm7Q9ESD6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cmtm7Q9ESD6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cmtm7Q9ESD6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cmtm7Q9ESD6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cmtm7Q9ESD6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cmtm7Q9ESD6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cmtm7Q9ESD6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cmtm7Q9ESD6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cmtm7Q9ESD6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cmtm7Q9ESD6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cmtm7Q9ESD6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms