Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp29Q9ES63 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms