Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD7

Tubb3, Tubulin beta-3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb3Q9ERD7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb3Q9ERD7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubb3Q9ERD7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubb3Q9ERD7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubb3Q9ERD7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubb3Q9ERD7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubb3Q9ERD7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubb3Q9ERD7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubb3Q9ERD7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb3Q9ERD7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb3Q9ERD7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb3Q9ERD7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb3Q9ERD7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb3Q9ERD7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb3Q9ERD7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb3Q9ERD7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb3Q9ERD7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb3Q9ERD7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb3Q9ERD7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb3Q9ERD7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb3Q9ERD7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb3Q9ERD7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb3Q9ERD7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb3Q9ERD7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb3Q9ERD7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb3Q9ERD7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb3Q9ERD7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb3Q9ERD7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb3Q9ERD7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb3Q9ERD7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb3Q9ERD7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb3Q9ERD7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb3Q9ERD7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb3Q9ERD7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb3Q9ERD7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb3Q9ERD7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb3Q9ERD7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb3Q9ERD7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb3Q9ERD7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb3Q9ERD7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb3Q9ERD7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb3Q9ERD7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms