Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tfip11Q9ERA6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tfip11Q9ERA6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms