Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQW4

Cyp3a44, Cytochrome P450, CYP3A, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a44Q9EQW4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp3a44Q9EQW4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp3a44Q9EQW4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp3a44Q9EQW4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp3a44Q9EQW4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp3a44Q9EQW4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp3a44Q9EQW4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp3a44Q9EQW4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp3a44Q9EQW4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp3a44Q9EQW4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp3a44Q9EQW4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp3a44Q9EQW4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp3a44Q9EQW4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp3a44Q9EQW4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp3a44Q9EQW4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp3a44Q9EQW4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp3a44Q9EQW4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp3a44Q9EQW4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp3a44Q9EQW4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp3a44Q9EQW4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp3a44Q9EQW4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp3a44Q9EQW4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp3a44Q9EQW4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp3a44Q9EQW4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp3a44Q9EQW4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cyp3a44Q9EQW4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cyp3a44Q9EQW4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cyp3a44Q9EQW4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp3a44Q9EQW4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms