Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQC0

Chst1, Carbohydrate sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst1Q9EQC0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chst1Q9EQC0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Chst1Q9EQC0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chst1Q9EQC0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chst1Q9EQC0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chst1Q9EQC0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chst1Q9EQC0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chst1Q9EQC0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chst1Q9EQC0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chst1Q9EQC0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chst1Q9EQC0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chst1Q9EQC0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chst1Q9EQC0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chst1Q9EQC0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chst1Q9EQC0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chst1Q9EQC0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chst1Q9EQC0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chst1Q9EQC0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chst1Q9EQC0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chst1Q9EQC0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chst1Q9EQC0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chst1Q9EQC0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chst1Q9EQC0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chst1Q9EQC0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chst1Q9EQC0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chst1Q9EQC0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chst1Q9EQC0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chst1Q9EQC0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chst1Q9EQC0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chst1Q9EQC0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chst1Q9EQC0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chst1Q9EQC0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Chst1Q9EQC0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chst1Q9EQC0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms