Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPE9

Atp13a1, Manganese-transporting ATPase 13A1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a1Q9EPE9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp13a1Q9EPE9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp13a1Q9EPE9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp13a1Q9EPE9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp13a1Q9EPE9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp13a1Q9EPE9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp13a1Q9EPE9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp13a1Q9EPE9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp13a1Q9EPE9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp13a1Q9EPE9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp13a1Q9EPE9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp13a1Q9EPE9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp13a1Q9EPE9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp13a1Q9EPE9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp13a1Q9EPE9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp13a1Q9EPE9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Atp13a1Q9EPE9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp13a1Q9EPE9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp13a1Q9EPE9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp13a1Q9EPE9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp13a1Q9EPE9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp13a1Q9EPE9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp13a1Q9EPE9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp13a1Q9EPE9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp13a1Q9EPE9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp13a1Q9EPE9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp13a1Q9EPE9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp13a1Q9EPE9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp13a1Q9EPE9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp13a1Q9EPE9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp13a1Q9EPE9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp13a1Q9EPE9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp13a1Q9EPE9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp13a1Q9EPE9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp13a1Q9EPE9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp13a1Q9EPE9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp13a1Q9EPE9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp13a1Q9EPE9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp13a1Q9EPE9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms