Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP79

Vmn1r52, Vomeronasal type-1 receptor 52, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r52Q9EP79 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r52Q9EP79 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r52Q9EP79 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r52Q9EP79 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r52Q9EP79 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r52Q9EP79 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r52Q9EP79 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r52Q9EP79 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r52Q9EP79 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r52Q9EP79 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r52Q9EP79 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r52Q9EP79 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r52Q9EP79 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r52Q9EP79 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r52Q9EP79 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r52Q9EP79 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r52Q9EP79 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r52Q9EP79 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r52Q9EP79 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r52Q9EP79 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r52Q9EP79 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r52Q9EP79 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r52Q9EP79 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r52Q9EP79 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r52Q9EP79 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r52Q9EP79 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r52Q9EP79 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r52Q9EP79 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r52Q9EP79 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r52Q9EP79 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r52Q9EP79 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r52Q9EP79 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r52Q9EP79 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r52Q9EP79 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r52Q9EP79 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r52Q9EP79 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r52Q9EP79 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r52Q9EP79 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r52Q9EP79 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r52Q9EP79 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r52Q9EP79 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r52Q9EP79 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r52Q9EP79 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vmn1r52Q9EP79 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vmn1r52Q9EP79 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vmn1r52Q9EP79 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vmn1r52Q9EP79 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r52Q9EP79 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms