Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnft1Q9DCN7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms