Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf6Q9DBU5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms