Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cmtr1Q9DBC3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cmtr1Q9DBC3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cmtr1Q9DBC3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cmtr1Q9DBC3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cmtr1Q9DBC3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cmtr1Q9DBC3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cmtr1Q9DBC3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cmtr1Q9DBC3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cmtr1Q9DBC3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cmtr1Q9DBC3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cmtr1Q9DBC3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cmtr1Q9DBC3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cmtr1Q9DBC3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Cmtr1Q9DBC3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cmtr1Q9DBC3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cmtr1Q9DBC3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cmtr1Q9DBC3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cmtr1Q9DBC3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cmtr1Q9DBC3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cmtr1Q9DBC3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cmtr1Q9DBC3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cmtr1Q9DBC3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cmtr1Q9DBC3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cmtr1Q9DBC3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cmtr1Q9DBC3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cmtr1Q9DBC3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cmtr1Q9DBC3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cmtr1Q9DBC3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cmtr1Q9DBC3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cmtr1Q9DBC3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cmtr1Q9DBC3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cmtr1Q9DBC3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cmtr1Q9DBC3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cmtr1Q9DBC3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cmtr1Q9DBC3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cmtr1Q9DBC3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cmtr1Q9DBC3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cmtr1Q9DBC3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cmtr1Q9DBC3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cmtr1Q9DBC3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cmtr1Q9DBC3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cmtr1Q9DBC3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cmtr1Q9DBC3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cmtr1Q9DBC3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cmtr1Q9DBC3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms