Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Smg9Q9DB90 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Smg9Q9DB90 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Smg9Q9DB90 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Smg9Q9DB90 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smg9Q9DB90 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smg9Q9DB90 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smg9Q9DB90 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Smg9Q9DB90 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smg9Q9DB90 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smg9Q9DB90 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smg9Q9DB90 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smg9Q9DB90 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smg9Q9DB90 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smg9Q9DB90 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Smg9Q9DB90 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smg9Q9DB90 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smg9Q9DB90 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smg9Q9DB90 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smg9Q9DB90 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smg9Q9DB90 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smg9Q9DB90 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smg9Q9DB90 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smg9Q9DB90 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smg9Q9DB90 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smg9Q9DB90 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smg9Q9DB90 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smg9Q9DB90 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Smg9Q9DB90 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smg9Q9DB90 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smg9Q9DB90 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Smg9Q9DB90 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smg9Q9DB90 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smg9Q9DB90 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smg9Q9DB90 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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Smg9Q9DB90 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smg9Q9DB90 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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Smg9Q9DB90 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smg9Q9DB90 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smg9Q9DB90 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smg9Q9DB90 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smg9Q9DB90 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smg9Q9DB90 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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Smg9Q9DB90 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smg9Q9DB90 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smg9Q9DB90 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smg9Q9DB90 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Smg9Q9DB90 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smg9Q9DB90 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Smg9Q9DB90 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smg9Q9DB90 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smg9Q9DB90 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smg9Q9DB90 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smg9Q9DB90 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smg9Q9DB90 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smg9Q9DB90 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smg9Q9DB90 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smg9Q9DB90 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smg9Q9DB90 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smg9Q9DB90 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smg9Q9DB90 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smg9Q9DB90 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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