Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Med27Q9DB40 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms