Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp2aQ9DB34 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp2aQ9DB34 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp2aQ9DB34 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp2aQ9DB34 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Chmp2aQ9DB34 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Chmp2aQ9DB34 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp2aQ9DB34 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Chmp2aQ9DB34 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Chmp2aQ9DB34 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chmp2aQ9DB34 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Chmp2aQ9DB34 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp2aQ9DB34 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp2aQ9DB34 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp2aQ9DB34 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp2aQ9DB34 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp2aQ9DB34 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp2aQ9DB34 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp2aQ9DB34 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp2aQ9DB34 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp2aQ9DB34 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp2aQ9DB34 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp2aQ9DB34 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp2aQ9DB34 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp2aQ9DB34 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chmp2aQ9DB34 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chmp2aQ9DB34 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chmp2aQ9DB34 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chmp2aQ9DB34 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chmp2aQ9DB34 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chmp2aQ9DB34 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chmp2aQ9DB34 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chmp2aQ9DB34 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chmp2aQ9DB34 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chmp2aQ9DB34 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chmp2aQ9DB34 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chmp2aQ9DB34 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chmp2aQ9DB34 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chmp2aQ9DB34 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chmp2aQ9DB34 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chmp2aQ9DB34 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chmp2aQ9DB34 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms