Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL3

Ccdc54, Coiled-coil domain-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc54Q9DAL3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc54Q9DAL3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms