Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9S1

UPF0193 protein EVG1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9S1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q9D9S1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9D9S1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q9D9S1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9D9S1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9D9S1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9D9S1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9D9S1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9D9S1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9D9S1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9D9S1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9D9S1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9D9S1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9D9S1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9D9S1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9D9S1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9D9S1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9D9S1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Q9D9S1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q9D9S1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Q9D9S1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q9D9S1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q9D9S1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Q9D9S1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Q9D9S1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Q9D9S1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Q9D9S1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q9D9S1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q9D9S1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Q9D9S1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q9D9S1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q9D9S1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q9D9S1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q9D9S1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q9D9S1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q9D9S1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9D9S1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9D9S1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9D9S1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9D9S1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9D9S1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9D9S1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9D9S1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9D9S1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9D9S1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9D9S1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9D9S1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9D9S1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9D9S1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms