Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp12Q9D9M2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp12Q9D9M2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp12Q9D9M2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp12Q9D9M2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp12Q9D9M2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp12Q9D9M2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
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Usp12Q9D9M2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp12Q9D9M2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms