Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Q9D9H8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Q9D9H8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Q9D9H8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Q9D9H8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Q9D9H8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Q9D9H8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Q9D9H8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Q9D9H8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Q9D9H8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Q9D9H8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Q9D9H8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Q9D9H8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Q9D9H8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Q9D9H8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Q9D9H8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Q9D9H8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Q9D9H8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Q9D9H8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Q9D9H8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Q9D9H8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Q9D9H8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Q9D9H8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Q9D9H8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Q9D9H8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Q9D9H8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Q9D9H8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Q9D9H8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Q9D9H8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Q9D9H8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Q9D9H8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Q9D9H8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Q9D9H8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Q9D9H8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Q9D9H8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Q9D9H8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Q9D9H8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Q9D9H8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Q9D9H8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Q9D9H8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Q9D9H8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Q9D9H8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Q9D9H8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Q9D9H8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Q9D9H8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Q9D9H8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Q9D9H8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Q9D9H8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Q9D9H8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Q9D9H8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Q9D9H8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Q9D9H8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Q9D9H8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Q9D9H8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Q9D9H8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Q9D9H8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Q9D9H8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Q9D9H8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Q9D9H8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Q9D9H8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Q9D9H8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Q9D9H8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Q9D9H8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Q9D9H8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Q9D9H8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Q9D9H8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Q9D9H8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Q9D9H8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Q9D9H8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Q9D9H8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Q9D9H8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Q9D9H8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Q9D9H8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Q9D9H8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Q9D9H8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Q9D9H8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Q9D9H8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Q9D9H8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Q9D9H8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Q9D9H8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Q9D9H8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Q9D9H8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Q9D9H8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Q9D9H8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Q9D9H8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Q9D9H8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Q9D9H8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Q9D9H8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Q9D9H8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Q9D9H8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Q9D9H8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Q9D9H8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Q9D9H8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Q9D9H8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Q9D9H8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Q9D9H8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Q9D9H8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Q9D9H8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Q9D9H8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Q9D9H8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms