Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slc52a2Q9D8F3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Slc52a2Q9D8F3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slc52a2Q9D8F3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slc52a2Q9D8F3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slc52a2Q9D8F3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slc52a2Q9D8F3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Slc52a2Q9D8F3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Slc52a2Q9D8F3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Slc52a2Q9D8F3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Slc52a2Q9D8F3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Slc52a2Q9D8F3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Slc52a2Q9D8F3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Slc52a2Q9D8F3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Slc52a2Q9D8F3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Slc52a2Q9D8F3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Slc52a2Q9D8F3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Slc52a2Q9D8F3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Slc52a2Q9D8F3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Slc52a2Q9D8F3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slc52a2Q9D8F3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slc52a2Q9D8F3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slc52a2Q9D8F3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slc52a2Q9D8F3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slc52a2Q9D8F3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Slc52a2Q9D8F3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slc52a2Q9D8F3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slc52a2Q9D8F3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slc52a2Q9D8F3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Slc52a2Q9D8F3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Slc52a2Q9D8F3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Slc52a2Q9D8F3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Slc52a2Q9D8F3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Slc52a2Q9D8F3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Slc52a2Q9D8F3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Slc52a2Q9D8F3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Slc52a2Q9D8F3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Slc52a2Q9D8F3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Slc52a2Q9D8F3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Slc52a2Q9D8F3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Slc52a2Q9D8F3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Slc52a2Q9D8F3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slc52a2Q9D8F3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slc52a2Q9D8F3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slc52a2Q9D8F3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slc52a2Q9D8F3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slc52a2Q9D8F3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slc52a2Q9D8F3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slc52a2Q9D8F3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slc52a2Q9D8F3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slc52a2Q9D8F3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slc52a2Q9D8F3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slc52a2Q9D8F3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slc52a2Q9D8F3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slc52a2Q9D8F3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slc52a2Q9D8F3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slc52a2Q9D8F3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slc52a2Q9D8F3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slc52a2Q9D8F3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slc52a2Q9D8F3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slc52a2Q9D8F3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Slc52a2Q9D8F3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Slc52a2Q9D8F3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Slc52a2Q9D8F3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Slc52a2Q9D8F3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slc52a2Q9D8F3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slc52a2Q9D8F3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slc52a2Q9D8F3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slc52a2Q9D8F3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slc52a2Q9D8F3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slc52a2Q9D8F3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slc52a2Q9D8F3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slc52a2Q9D8F3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slc52a2Q9D8F3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slc52a2Q9D8F3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slc52a2Q9D8F3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slc52a2Q9D8F3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slc52a2Q9D8F3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slc52a2Q9D8F3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slc52a2Q9D8F3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Slc52a2Q9D8F3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slc52a2Q9D8F3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Slc52a2Q9D8F3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Slc52a2Q9D8F3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Slc52a2Q9D8F3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Slc52a2Q9D8F3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Slc52a2Q9D8F3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Slc52a2Q9D8F3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Slc52a2Q9D8F3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Slc52a2Q9D8F3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Slc52a2Q9D8F3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Slc52a2Q9D8F3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Slc52a2Q9D8F3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Slc52a2Q9D8F3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Slc52a2Q9D8F3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Slc52a2Q9D8F3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Slc52a2Q9D8F3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Slc52a2Q9D8F3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Slc52a2Q9D8F3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Slc52a2Q9D8F3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms