Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms