Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
U2af1Q9D883 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
U2af1Q9D883 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
U2af1Q9D883 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
U2af1Q9D883 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
U2af1Q9D883 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
U2af1Q9D883 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
U2af1Q9D883 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
U2af1Q9D883 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
U2af1Q9D883 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
U2af1Q9D883 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
U2af1Q9D883 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
U2af1Q9D883 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
U2af1Q9D883 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
U2af1Q9D883 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
U2af1Q9D883 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
U2af1Q9D883 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
U2af1Q9D883 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
U2af1Q9D883 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
U2af1Q9D883 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
U2af1Q9D883 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
U2af1Q9D883 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
U2af1Q9D883 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
U2af1Q9D883 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
U2af1Q9D883 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
U2af1Q9D883 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
U2af1Q9D883 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
U2af1Q9D883 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
U2af1Q9D883 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
U2af1Q9D883 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
U2af1Q9D883 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
U2af1Q9D883 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
U2af1Q9D883 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
U2af1Q9D883 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
U2af1Q9D883 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
U2af1Q9D883 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
U2af1Q9D883 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
U2af1Q9D883 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
U2af1Q9D883 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
U2af1Q9D883 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
U2af1Q9D883 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
U2af1Q9D883 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
U2af1Q9D883 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
U2af1Q9D883 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
U2af1Q9D883 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
U2af1Q9D883 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
U2af1Q9D883 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
U2af1Q9D883 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
U2af1Q9D883 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
U2af1Q9D883 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
U2af1Q9D883 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
U2af1Q9D883 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
U2af1Q9D883 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
U2af1Q9D883 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
U2af1Q9D883 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
U2af1Q9D883 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
U2af1Q9D883 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
U2af1Q9D883 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
U2af1Q9D883 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
U2af1Q9D883 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
U2af1Q9D883 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
U2af1Q9D883 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
U2af1Q9D883 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
U2af1Q9D883 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
U2af1Q9D883 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
U2af1Q9D883 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
U2af1Q9D883 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
U2af1Q9D883 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
U2af1Q9D883 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
U2af1Q9D883 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
U2af1Q9D883 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
U2af1Q9D883 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
U2af1Q9D883 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
U2af1Q9D883 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
U2af1Q9D883 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
U2af1Q9D883 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
U2af1Q9D883 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
U2af1Q9D883 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
U2af1Q9D883 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
U2af1Q9D883 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
U2af1Q9D883 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
U2af1Q9D883 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
U2af1Q9D883 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
U2af1Q9D883 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
U2af1Q9D883 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
U2af1Q9D883 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
U2af1Q9D883 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
U2af1Q9D883 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
U2af1Q9D883 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
U2af1Q9D883 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
U2af1Q9D883 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
U2af1Q9D883 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
U2af1Q9D883 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
U2af1Q9D883 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
U2af1Q9D883 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
U2af1Q9D883 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
U2af1Q9D883 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
U2af1Q9D883 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
U2af1Q9D883 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
U2af1Q9D883 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms