Protein–RNA interactions for Protein: Q9D842

Aplf, Aprataxin and PNK-like factor, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AplfQ9D842 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms