Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms