Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chmp5Q9D7S9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chmp5Q9D7S9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chmp5Q9D7S9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chmp5Q9D7S9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chmp5Q9D7S9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chmp5Q9D7S9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chmp5Q9D7S9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chmp5Q9D7S9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chmp5Q9D7S9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chmp5Q9D7S9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Chmp5Q9D7S9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chmp5Q9D7S9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chmp5Q9D7S9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chmp5Q9D7S9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chmp5Q9D7S9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chmp5Q9D7S9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chmp5Q9D7S9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chmp5Q9D7S9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chmp5Q9D7S9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chmp5Q9D7S9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chmp5Q9D7S9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chmp5Q9D7S9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chmp5Q9D7S9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chmp5Q9D7S9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chmp5Q9D7S9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chmp5Q9D7S9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chmp5Q9D7S9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chmp5Q9D7S9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chmp5Q9D7S9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chmp5Q9D7S9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chmp5Q9D7S9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chmp5Q9D7S9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chmp5Q9D7S9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chmp5Q9D7S9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms