Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Srp19Q9D7A6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Srp19Q9D7A6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp19Q9D7A6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms