Protein–RNA interactions for Protein: Q9D711

Pir, Pirin, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PirQ9D711 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PirQ9D711 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PirQ9D711 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PirQ9D711 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PirQ9D711 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PirQ9D711 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PirQ9D711 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PirQ9D711 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PirQ9D711 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PirQ9D711 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PirQ9D711 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PirQ9D711 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PirQ9D711 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PirQ9D711 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PirQ9D711 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PirQ9D711 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PirQ9D711 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PirQ9D711 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PirQ9D711 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PirQ9D711 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PirQ9D711 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PirQ9D711 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PirQ9D711 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PirQ9D711 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PirQ9D711 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PirQ9D711 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PirQ9D711 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PirQ9D711 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PirQ9D711 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PirQ9D711 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PirQ9D711 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PirQ9D711 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PirQ9D711 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PirQ9D711 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PirQ9D711 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PirQ9D711 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PirQ9D711 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PirQ9D711 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PirQ9D711 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PirQ9D711 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PirQ9D711 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PirQ9D711 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PirQ9D711 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PirQ9D711 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PirQ9D711 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PirQ9D711 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PirQ9D711 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PirQ9D711 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PirQ9D711 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PirQ9D711 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PirQ9D711 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PirQ9D711 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PirQ9D711 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PirQ9D711 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PirQ9D711 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PirQ9D711 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PirQ9D711 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PirQ9D711 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PirQ9D711 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PirQ9D711 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PirQ9D711 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PirQ9D711 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PirQ9D711 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PirQ9D711 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PirQ9D711 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PirQ9D711 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PirQ9D711 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PirQ9D711 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PirQ9D711 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PirQ9D711 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PirQ9D711 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PirQ9D711 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PirQ9D711 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PirQ9D711 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PirQ9D711 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PirQ9D711 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PirQ9D711 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PirQ9D711 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PirQ9D711 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PirQ9D711 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
PirQ9D711 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PirQ9D711 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PirQ9D711 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PirQ9D711 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PirQ9D711 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms