Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbe1Q9D6Y9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms