Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubb4aQ9D6F9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubb4aQ9D6F9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubb4aQ9D6F9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubb4aQ9D6F9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubb4aQ9D6F9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubb4aQ9D6F9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubb4aQ9D6F9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubb4aQ9D6F9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubb4aQ9D6F9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubb4aQ9D6F9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubb4aQ9D6F9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubb4aQ9D6F9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubb4aQ9D6F9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubb4aQ9D6F9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubb4aQ9D6F9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubb4aQ9D6F9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubb4aQ9D6F9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubb4aQ9D6F9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubb4aQ9D6F9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubb4aQ9D6F9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubb4aQ9D6F9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubb4aQ9D6F9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubb4aQ9D6F9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubb4aQ9D6F9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubb4aQ9D6F9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubb4aQ9D6F9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubb4aQ9D6F9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubb4aQ9D6F9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubb4aQ9D6F9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubb4aQ9D6F9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubb4aQ9D6F9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubb4aQ9D6F9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tubb4aQ9D6F9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tubb4aQ9D6F9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tubb4aQ9D6F9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tubb4aQ9D6F9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tubb4aQ9D6F9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tubb4aQ9D6F9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tubb4aQ9D6F9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubb4aQ9D6F9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubb4aQ9D6F9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubb4aQ9D6F9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubb4aQ9D6F9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb4aQ9D6F9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb4aQ9D6F9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb4aQ9D6F9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb4aQ9D6F9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb4aQ9D6F9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb4aQ9D6F9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubb4aQ9D6F9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubb4aQ9D6F9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubb4aQ9D6F9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubb4aQ9D6F9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubb4aQ9D6F9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubb4aQ9D6F9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubb4aQ9D6F9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubb4aQ9D6F9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubb4aQ9D6F9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubb4aQ9D6F9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubb4aQ9D6F9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubb4aQ9D6F9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubb4aQ9D6F9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubb4aQ9D6F9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubb4aQ9D6F9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubb4aQ9D6F9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubb4aQ9D6F9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubb4aQ9D6F9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubb4aQ9D6F9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubb4aQ9D6F9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubb4aQ9D6F9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubb4aQ9D6F9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubb4aQ9D6F9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubb4aQ9D6F9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubb4aQ9D6F9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubb4aQ9D6F9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubb4aQ9D6F9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubb4aQ9D6F9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubb4aQ9D6F9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubb4aQ9D6F9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms