Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc9bQ9D6E4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttc9bQ9D6E4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttc9bQ9D6E4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttc9bQ9D6E4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttc9bQ9D6E4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttc9bQ9D6E4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc9bQ9D6E4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc9bQ9D6E4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc9bQ9D6E4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc9bQ9D6E4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc9bQ9D6E4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc9bQ9D6E4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc9bQ9D6E4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc9bQ9D6E4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc9bQ9D6E4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc9bQ9D6E4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc9bQ9D6E4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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