Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt34Q9D646 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt34Q9D646 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt34Q9D646 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt34Q9D646 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt34Q9D646 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt34Q9D646 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt34Q9D646 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt34Q9D646 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt34Q9D646 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt34Q9D646 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt34Q9D646 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt34Q9D646 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt34Q9D646 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt34Q9D646 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt34Q9D646 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt34Q9D646 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt34Q9D646 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt34Q9D646 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt34Q9D646 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt34Q9D646 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt34Q9D646 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt34Q9D646 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt34Q9D646 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt34Q9D646 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt34Q9D646 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt34Q9D646 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt34Q9D646 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt34Q9D646 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt34Q9D646 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms